三甲基硅烷基重氮甲烷和重氮甲烷都是含有重氮基的有机化合物，但它们在结构上有一些区别。

首先，三甲基硅烷基重氮甲烷的分子结构中含有一个硅原子，而重氮甲烷的分子结构则没有。这意味着三甲基硅烷基重氮甲烷的化学性质会受到硅原子的影响，而重氮甲烷则不会。

其次，由于硅原子的存在，三甲基硅烷基重氮甲烷的分子结构比重氮甲烷更加稳定。这种稳定性在一些化学反应中非常有用，因为它可以防止分子的结构发生变化或者分解。

最后，在应用上，三甲基硅烷基重氮甲烷和重氮甲烷也有一些区别。三甲基硅烷基重氮甲烷可以作为一种稳定的重氮化合物在一些有机合成反应中发挥作用，而重氮甲烷则更多地用于一些物理实验中。

总之，尽管三甲基硅烷基重氮甲烷和重氮甲烷都是含有重氮基的有机化合物，但它们在结构和应用上都有一些区别。